Есть расхожее мнение: бухгалтер с аттестатом на практике далеко не «профи», реально квалифицированным кадрам постоянно учиться некогда, потому что они работают.
Вернуть сотруднику излишне удержанный НДФЛ можно за счет сумм, которые причитаются к уплате за всех остальных сотрудников. Если этих денег не хватает, то работодатель возвращает переплату из ИФНС.